Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpreP49446 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtpreP49446 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpreP49446 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpreP49446 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpreP49446 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpreP49446 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpreP49446 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpreP49446 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpreP49446 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms