Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbp3P49194 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rbp3P49194 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbp3P49194 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms