Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnni3P48787 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnni3P48787 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnni3P48787 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnni3P48787 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms