Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl5P47962 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl5P47962 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl5P47962 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms