Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfpt1P47856 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfpt1P47856 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfpt1P47856 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms