Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SrprbP47758 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrprbP47758 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SrprbP47758 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrprbP47758 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrprbP47758 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms