Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlx1P43345 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tlx1P43345 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlx1P43345 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms