Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf7P43029 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf7P43029 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf7P43029 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf7P43029 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms