Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighmbp2P40694 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighmbp2P40694 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighmbp2P40694 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms