Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csf3rP40223 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csf3rP40223 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csf3rP40223 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms