Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab17P35292 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab17P35292 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab17P35292 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab17P35292 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab17P35292 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab17P35292 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab17P35292 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab17P35292 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab17P35292 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms