Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn11P35235 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn11P35235 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn11P35235 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms