Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfap2aP34056 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tfap2aP34056 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2aP34056 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms