Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoc3P33622 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc3P33622 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc3P33622 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms