Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxrgP28705 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxrgP28705 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxrgP28705 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RxrgP28705 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RxrgP28705 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxrgP28705 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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