Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col2a1P28481 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col2a1P28481 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col2a1P28481 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col2a1P28481 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms