Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd9P28357 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxd9P28357 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd9P28357 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms