Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa5P28312 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa5P28312 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa5P28312 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa5P28312 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa5P28312 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms