Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsgP28293 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsgP28293 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsgP28293 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms