Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aco1P28271 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aco1P28271 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aco1P28271 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aco1P28271 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aco1P28271 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aco1P28271 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aco1P28271 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aco1P28271 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aco1P28271 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aco1P28271 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms