Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb1P28230 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gjb1P28230 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjb1P28230 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjb1P28230 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms