Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-DMaP28078 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-DMaP28078 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-DMaP28078 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-DMaP28078 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-DMaP28078 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-DMaP28078 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-DMaP28078 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-DMaP28078 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms