Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af2P26369 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af2P26369 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af2P26369 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af2P26369 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af2P26369 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U2af2P26369 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U2af2P26369 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af2P26369 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U2af2P26369 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms