Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gata3P23772 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gata3P23772 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata3P23772 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gata3P23772 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gata3P23772 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms