Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tsta3P23591 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tsta3P23591 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsta3P23591 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsta3P23591 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsta3P23591 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms