Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ggta1P23336 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ggta1P23336 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ggta1P23336 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ggta1P23336 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms