Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja1P23242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja1P23242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja1P23242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja1P23242 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja1P23242 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms