Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubl4aP21126 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubl4aP21126 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubl4aP21126 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms