Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KitlgP20826 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KitlgP20826 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KitlgP20826 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KitlgP20826 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KitlgP20826 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms