Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou5f1P20263 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pou5f1P20263 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou5f1P20263 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms