Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ntf3P20181 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ntf3P20181 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ntf3P20181 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms