Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rps6ka3P18654 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps6ka3P18654 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps6ka3P18654 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms