Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata1P17679 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata1P17679 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gata1P17679 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata1P17679 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms