Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ass1P16460 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ass1P16460 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ass1P16460 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ass1P16460 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ass1P16460 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ass1P16460 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ass1P16460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ass1P16460 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ass1P16460 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ass1P16460 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ass1P16460 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ass1P16460 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms