Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CnpP16330 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CnpP16330 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CnpP16330 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CnpP16330 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CnpP16330 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CnpP16330 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CnpP16330 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CnpP16330 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CnpP16330 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CnpP16330 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CnpP16330 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CnpP16330 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CnpP16330 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CnpP16330 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CnpP16330 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CnpP16330 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CnpP16330 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CnpP16330 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CnpP16330 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CnpP16330 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CnpP16330 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CnpP16330 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CnpP16330 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CnpP16330 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CnpP16330 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CnpP16330 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CnpP16330 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CnpP16330 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CnpP16330 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CnpP16330 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CnpP16330 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CnpP16330 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CnpP16330 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CnpP16330 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CnpP16330 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CnpP16330 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CnpP16330 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CnpP16330 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CnpP16330 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CnpP16330 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CnpP16330 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CnpP16330 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CnpP16330 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CnpP16330 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CnpP16330 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CnpP16330 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CnpP16330 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CnpP16330 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CnpP16330 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CnpP16330 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CnpP16330 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CnpP16330 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CnpP16330 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CnpP16330 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CnpP16330 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CnpP16330 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CnpP16330 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CnpP16330 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CnpP16330 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CnpP16330 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CnpP16330 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CnpP16330 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CnpP16330 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CnpP16330 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms