Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ca3P16015 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ca3P16015 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca3P16015 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ca3P16015 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ca3P16015 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ca3P16015 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca3P16015 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca3P16015 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms