Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrgnP13609 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrgnP13609 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrgnP13609 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrgnP13609 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrgnP13609 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SrgnP13609 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrgnP13609 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrgnP13609 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrgnP13609 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrgnP13609 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms