Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DmdP11531 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DmdP11531 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DmdP11531 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DmdP11531 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DmdP11531 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DmdP11531 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DmdP11531 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DmdP11531 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DmdP11531 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DmdP11531 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DmdP11531 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DmdP11531 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DmdP11531 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DmdP11531 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DmdP11531 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DmdP11531 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DmdP11531 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DmdP11531 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DmdP11531 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DmdP11531 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DmdP11531 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DmdP11531 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DmdP11531 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DmdP11531 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DmdP11531 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DmdP11531 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DmdP11531 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DmdP11531 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DmdP11531 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DmdP11531 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DmdP11531 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DmdP11531 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DmdP11531 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DmdP11531 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DmdP11531 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DmdP11531 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DmdP11531 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DmdP11531 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DmdP11531 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DmdP11531 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DmdP11531 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DmdP11531 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DmdP11531 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DmdP11531 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DmdP11531 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DmdP11531 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DmdP11531 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DmdP11531 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DmdP11531 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DmdP11531 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DmdP11531 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DmdP11531 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
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