Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxc6P10629 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc6P10629 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc6P10629 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc6P10629 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms