Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ly6c1P0CW02 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6c1P0CW02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6c1P0CW02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms