Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UbbP0CG49 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UbbP0CG49 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UbbP0CG49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms