Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wipf3P0C7L0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wipf3P0C7L0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wipf3P0C7L0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wipf3P0C7L0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wipf3P0C7L0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wipf3P0C7L0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Wipf3P0C7L0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Wipf3P0C7L0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms