Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa9P09631 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxa9P09631 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa9P09631 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms