Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb1P09055 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb1P09055 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb1P09055 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms