Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa5P09021 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxa5P09021 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa5P09021 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms