Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col3a1P08121 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col3a1P08121 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col3a1P08121 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Col3a1P08121 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms