Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Egr1P08046 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Egr1P08046 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Egr1P08046 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Egr1P08046 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Egr1P08046 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr1P08046 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Egr1P08046 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr1P08046 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Egr1P08046 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Egr1P08046 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Egr1P08046 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms