Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spta1P08032 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Spta1P08032 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spta1P08032 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spta1P08032 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spta1P08032 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spta1P08032 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spta1P08032 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spta1P08032 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 375 ms