Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb1bP06795 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb1bP06795 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb1bP06795 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1bP06795 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms