Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06328 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06328 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06328 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06328 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06328 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06328 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06328 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06328 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06328 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06328 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06328 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06328 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06328 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06328 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06328 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06328 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms